Metagenome Family F019953

Basic Information
Family ID	F019953
Family Type	Metagenome
Number of Sequences	226
Average Sequence Length	45 residues
Representative Sequence	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPKG
Number of Associated Samples	11
Number of Associated Scaffolds	226

Quality Assessment
Transcriptomic Evidence	No
Most common taxonomic group	Unclassified
% of genes with valid RBS motifs	0.00 %
% of genes near scaffold ends (potentially truncated)	0.00 %
% of genes from short scaffolds (< 2000 bps)	0.00 %
Associated GOLD sequencing projects	6
AlphaFold2 3D model prediction	No

Hidden Markov Model


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Most Common Taxonomy
Group	Unclassified (100.000 % of family members)
NCBI Taxonomy ID	N/A
Taxonomy	N/A

Most Common Ecosystem
GOLD Ecosystem	Host-Associated → Annelida → Digestive System → Digestive Tube → Extracellular Symbionts → Marine Gutless Worms Symbiont (100.000 % of family members)
Environment Ontology (ENVO)	Unclassified (100.000 % of family members)
Earth Microbiome Project Ontology (EMPO)	Host-associated → Animal → Animal proximal gut (100.000 % of family members)

Full Alignment
Alignment of all the sequences in the family.

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Seed Alignment
Alignment of a non-redundant set of sequences, used to build the family's HMM profile.

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AlphaFold2 Input Alignment
Refined alignment used as input for AlphaFold2.

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Predicted Topology & Secondary Structure
Classification:	Globular	Signal Peptide:	No	Secondary Structure distribution:	α-helix: 28.26% β-sheet: 0.00% Coil/Unstructured: 71.74%
Feature Viewer

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Pfam ID	Name	% Frequency in 226 Family Scaffolds
PF00078	RVT_1	0.88
PF01853	MOZ_SAS	0.44
PF01391	Collagen	0.44
PF00233	PDEase_I	0.44
PF01826	TIL	0.44
PF00001	7tm_1	0.44
PF00211	Guanylate_cyc	0.44
PF00605	IRF	0.44
PF00094	VWD	0.44
PF16423	COE1_HLH	0.44
PF07679	I-set	0.44
PF00160	Pro_isomerase	0.44
PF00462	Glutaredoxin	0.44

COG ID	Name	Functional Category	% Frequency in 226 Family Scaffolds
COG0652	Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family	Posttranslational modification, protein turnover, chaperones [O]	0.44
COG2114	Adenylate cyclase, class 3	Signal transduction mechanisms [T]	0.44

Name	Rank	Taxonomy	Distribution
Unclassified	root	N/A	100.00 %

Visualization

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Habitat	Taxonomy	Distribution
Host-Associated	Host-Associated	100.00%

Habitat	Taxonomy	Distribution
Annelida	Host-Associated → Annelida	100.00%

Habitat	Taxonomy	Distribution
Digestive System	Host-Associated → Annelida → Digestive System	100.00%

Habitat	Taxonomy	Distribution
Digestive Tube	Host-Associated → Annelida → Digestive System → Digestive Tube	100.00%

Habitat	Taxonomy	Distribution
Extracellular Symbionts	Host-Associated → Annelida → Digestive System → Digestive Tube → Extracellular Symbionts	100.00%

Habitat	Taxonomy	Distribution
Marine Gutless Worms Symbiont	Host-Associated → Annelida → Digestive System → Digestive Tube → Extracellular Symbionts → Marine Gutless Worms Symbiont	100.00%

Visualization

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Taxon OID	Sample Name	Habitat Type	IMG/M Link
3300005652	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1a BELIZE.1	Host-Associated	Open in IMG/M
3300005653	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 2 BELIZE.1	Host-Associated	Open in IMG/M
3300005970	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 2 BELIZE.2	Host-Associated	Open in IMG/M
3300005999	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1a BELIZE.2	Host-Associated	Open in IMG/M
3300007818	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1 BERMUDA.2	Host-Associated	Open in IMG/M
3300008215	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1 BERMUDA.1	Host-Associated	Open in IMG/M
3300027001	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1a BELIZE.2 (SPAdes)	Host-Associated	Open in IMG/M
3300027044	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1 BERMUDA.2 (SPAdes)	Host-Associated	Open in IMG/M
3300027624	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 2 BELIZE.2 (SPAdes)	Host-Associated	Open in IMG/M
3300027658	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 2 BELIZE.1 (SPAdes)	Host-Associated	Open in IMG/M
3300027661	Marine gutless worms symbiont microbial communities from Max Planck institute for Marine Microbiology, Germany - Inanidrilus leukodermatus Group 1a BELIZE.1 (SPAdes)	Host-Associated	Open in IMG/M

Geographical Distribution

Zoom:	Powered by OpenStreetMap

Family Sequences

Protein ID	Sample Taxon ID	Habitat	Sequence
Ga0056135_100353115	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPK
Ga0056135_100579281	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPKE*
Ga0056135_100732686	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHRVLPANNTMPAFPLWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTH
Ga0056135_100800111	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTRLSTPKG*
Ga0056135_101189544	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	GMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTNLSTPKG*
Ga0056135_101701772	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	KRSGMDHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVTTTATEAADIQLHLTTHLSTPKG*
Ga0056135_101747292	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMAAFPSWCSPDVITTATEAADIQLQLTTHLSTLKGQKAELA*
Ga0056135_101826301	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	GMDHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVATTATEAADIQLQLTTY*
Ga0056135_101982601	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	GMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLLTPKG*
Ga0056135_102064591	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	HTVLPANNTMPAFPSWHSPDVTTTATEAADIQLQLTTHL*
Ga0056135_102128822	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	APFCTKVHTKRSGMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVATTAAEAADIQLQLTTHL*
Ga0056135_102333241	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	VLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPKG*
Ga0056135_102336014	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTAATEAADIQLQLT
Ga0056135_102459453	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MEHTANNTMPAFLRERSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPER
Ga0056135_102600132	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTGLSANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTP
Ga0056135_102716432	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVATTATEAADIQLQLTTHLLTPKG*
Ga0056135_102771141	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MGHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVATTATEAADIQLQLTTHL
Ga0056135_103486081	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MVHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHL
Ga0056135_103503031	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTAAKAADIQLQLTTHLSTPKG*
Ga0056135_103718911	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	TKVHTKRSGMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPKG*
Ga0056135_104174581	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	RSGMDHTVLPANNTMPAFPSWRSSDVTTTATEAADIQLQPTTHLSTPKG*
Ga0056135_104417602	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVTTTATEAADIQLQLTT
Ga0056135_104439791	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	TKVHTKRSGMDHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVTTTATEAEDIQLLLTTHLSTPKG*
Ga0056135_104716792	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTTPAFPLWHSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTP
Ga0056135_105738081	3300005652	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWHSPDVTTTATEAADIQLQL
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Ga0056133_100536061	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPANNTMPAFPSWRSSDVTTTATEAADIQLQLTT
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Ga0056133_100959151	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	GMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTNL*
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Ga0056133_102055393	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	SGMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLSTPKR*
Ga0056133_102070474	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	MPAFPSWRSPDVTTTATEAADIQLQLTTHLLTPKG*
Ga0056133_102194591	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	SGMDHTVLPANNTMPAFPSWRSPDVTTTATDIQLQLTTHLSTPKG*
Ga0056133_102439033	3300005653	Marine Gutless Worms Symbiont	MDHTVLPAHNTMPAFPSWRSPDGTTTATEAADIQLQLTTH
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NMPFamsDB

NMPFamsDB

NMPFamsDB

A database of Novel Metagenome Protein Families

A database of Novel Metagenome Protein Clusters

A database of Novel Metagenome Protein Clusters

Metagenome Family F019953

Overview

Multiple Sequence Alignments

Structure & Topology

Predicted Secondary Structure and Topology

Gene Neighborhood

Neighboring Pfam domains

Neighboring Clusters of Orthologous Genes (COGs)

Phylogeny

NCBI Taxonomy

Associated Scaffolds

Environmental Properties

Associated Habitat Types

Associated Samples

Family Sequences